内容发布更新时间 : 2024/11/19 1:40:07星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。

1. FASTA序列查询及含义

登录NCBI官方网站（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/） [National Center for Biotechnology Information]

用NCBI查找到你所需要的序列（核酸、蛋白质），如下图所示

图中有你所搜索的基因的名称、来源物种、长度、发现方式、发现年份、编号和描述

点击FASTA，得到FASTA序列

FASTA格式是指序列文件的第一行是由大于符号打头，之后跟随文字说明，第二行是序列本身，使用标准的核苷酸或蛋白质单字母符号，每行通常为60个字符（不超过80个字符）。 对于核酸序列，除了为大家所熟知的A、G、C、T、U外，R代表C或A（嘌呤）；Y代表T或C（嘧啶）；K代表G或T（带酮基）；M代表A或C（带氨基）；S代表G或C（强）；W代表A或T（弱）B代表G、T或C；D代表G、A或T；H代表A、C或T；V代表G、C或A；N代表A、G、C、T中任意一种。

2. 编码的氨基酸序列

在核酸序列界面的右下角有Protein选项，点击后即可进入氨基酸序列

得到的序列依然是使用FASTA格式的。

3. 蛋白质功能域

在蛋白质FASTA格式界面点击RUN BLAST，相当于BlASTp，能与蛋白质数据库进行比对，得到其功能域结果