内容发布更新时间 : 2024/12/22 17:01:11星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。
NTSYSpc软件的使用:
(1) 利用NTSYS软件计算品种间遗传距离
1.将已赋值好的Excel文件放于桌面,假设命名为A.xls,保存为Microsoft office 5.0/95工作薄形式。Excel文件格式设成软件识别的模式,即A1=1,表示出现等位基因;B1=132,表示等位基因数,C1=189表示品种数;D1=0表示不出现等位基因。从A3开始,在第一列标上所有的SSR引物,从B2开始,第二行标上所有的品种名,由此得到一个数据矩阵。
2.双击NTSYS软件,选择file→edit file,选择A.xls文件,将出现NTedit1.2编辑器,点击file→sale file as选项,将导入的Excel文件转换为软件识别的格式,命名为A-1.NTS文件。
3.点击Ntsyspc2.1界面的“Similarity”,点击“Genetic distance”;在Input data file中输入A-1.NTS;在Output file中输入A-2.NTS,点击Compute;则计算好的遗传距离放在A-2.NTS文件中。
4.点击Ntsyspc2.1界面的output&transf→output→Input file,选择A-2.NTS,即可查看到品种间的遗传距离。
(2) 利用NTSYS软件构建树状图
1.双击NTSYS-PC,点击similarity→Qualitative data→Input data file,选择A-1.NTS文件,在Output file中输入B-2文件,点击Compute;
2.点击clustering→SHAN→input file,选择B-2→Output file中输入B-2文件→In case of ties改为Find→compute计算完成。
3.点击Graphics→tree plot→input file,选择B-3→compute,即可出现聚类图。
4.点击Tree Plot界面上的Options→plot Options;会出现一个对话框,里面可对聚类图进行页面显示等相关操作。点击Tree Plot界面上的Edit项,可进行复制等操作
楼主的结果正是我想要的,我的问题就在于 最开始的excel数据怎么input的问题,总是提示我格式不对什么的~~
我不知你是怎么做的,你按照以下的方法试试,DDE和OLE格式可能与microsoft office的版本有关,使用OLE方式应该就没有什么问题了.如果还不行那就是软件的问题了.
5. 6. 7.
8.2.5 其他数据的聚类方法与此类似,在此不再赘述。
应楼主的要求,将前些天的帖子按标准格式发表.
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=10&id=1354147&sty=1