内容发布更新时间 : 2024/12/24 7:41:42星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。
IPProtocol
1.铺板:按一定细胞数将细胞接种于培养皿内,24h后进行处理。(转染质粒时,细胞长到90%以上较为合适。一次IP,使用6孔板足够。) 2.转染:lipo2000转染质粒,质粒转染效果应该提前验证。
(IP转染质粒时,被拽的一个蛋白可以适当加大转染量;如IP FLAG,用FLAG拉HA,总转染体系500ng时,对照组转空载质粒500ng;FLAG组转200ngFLAG+300ng空载;HA组转300ngHA+200ng空载;共转组300ngHA+200ngFLAG。)
3.细胞裂解:将培养皿置于冰面,弃培养液,预冷PBS洗一遍。加入事先配置好预冷的lysis buffer +PMSF+cocktail+Na3VO4等(如果是蛋白修饰反应需额外加)(6孔板每孔可加入1ml), 放置4℃摇床摇10min,裂解细胞。如皿底裂解不完全,可以用枪轻轻吹打几次。(裂解后皿底可见白色的丝状物,为DNA等成分。此步最好不要vortex。)
4.离心:4℃12000 rpm离心15min,上清即为裂解后的蛋白样品。
5. Beads准备:取出Beads(交联了IP抗体的Agarose Beads),使用前混合均匀。另取一只15ml离心管,根据每个样品1ml的用量加入相应的lysis buffer,然后以每个样品10-20ulBeads的量将Beads加入lysis buffer中,充分重悬后,分装至1.5ml EP管内,4℃ 1000-2000rpm 离心2min。弃上清(不要完全吸干,上样枪头)。
6. 将步骤4中离心后上清转移到新的硅化EP管内。 ① 每个样品各取出80ul做为input。
②IP:每个样品各取800ul上清加入事先备好的Beads中,放置于4℃转子上旋转充分孵育2h。
(孵育的时间需要调整,一般外源过表达IP 2-4H足够;若互作为底物反应,在IP前需要适当加入的MG132或其它相应的抑制剂。)
7. Beads的清洗:取出IP样品,4℃ 1000-2000rpm 离心 2min。弃上清。 清洗4遍:每个样品各加入1ml lysis buffer,放置于4℃转子上旋转10min,取出后4℃ 1000-2000rpm 离心 2min弃上清(每次不要吸干,保留一点点水分,最后一遍用压扁的上样枪头完全吸干水份)。
5、根据抗体说明书向上清中加入适当体积的抗体。4℃慢转2h。 说明:
1、IP 如果超声或裂解液内有强去垢剂,将会使蛋白质间的相互作用降低。 2、IP 所用抗体于IB所用抗体最好为不同种属。 3、一般在50KD位置会有抗体重链条带。
4、当做外转蛋白时需要加一组空载体对照,如单纯内源性蛋白的相互作用时需要加入IgG 空白组。 5、905配方:
Lysis buffer: 0.5%NP-40; 150mM NaCl; 50Mm Tris; HCl- PH7.5 Washing buffer: 0.1%NP-40; 150mM NaCl; 50Mm Tris; HCl- PH7.5 6.Yu Lab lysis buffer and washing buffer: RIPA buffer: Tris 50mM pH7.5, Nacl 150 mM, SDS 0.1%,
Na.Deoxycholate0.5 %, Triton X 100 or NP40 1%
1mM PMSF,RocheComplete Protease inhibitor