分子生物学实验技术实验内容概要 下载本文

内容发布更新时间 : 2024/5/21 4:25:24星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。

2006年《分子生物学实验技术》实验内容

一、RT-PCR

(一)总RNA的提取

实验安排:

每两人抽提一管。为了使操作同步以节省时间,各组样品请一起离心。

操作步骤:

1、将100μl液体样品加入1.5ml Ep管中,再加入900μl冰预冷的LS-BiotragentsTM(苯酚和异硫氰酸胍的混合物)。

2、将样品剧烈混合后,在室温放置5min。

3、加入200μl氯仿,颠倒Ep管混和两次,并剧烈振荡混和10s。 4、在4℃条件下,以10000×g离心15min。

5、将上层水相转移到一个新的Ep管中,加入等体积的异丙醇(Isopropanol)并混匀,然后在4℃放置至少10min。

6、在4℃条件下,以10000×g离心15min后,小心并尽可能地去除全部上清夜。 7、用1ml 75%乙醇洗涤RNA沉淀和管壁。

8、将RNA沉淀进行干燥(不能完全干燥)处理后,用10μl无RNase污染的水(RNase-Free Water)将RNA溶解并于-20℃保存。

注意事项:

1、所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。 2、所用的塑料材料,如吸头、离心管等需用0.1% DEPC水浸泡过夜。

3、配制的溶液应尽可能用0.1% DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌。

4、操作人员需在超净工作台上操作,并戴一次性口罩、手套,实验过程中手套要勤换。

(二)反转录

实验安排:

每人做一管。

反应体系(20μl):按下列顺序加样

注意事项:

1、加样时,一般从体积大的开始加,样品最后加。如在一般的PCR反应体系中,应先加水、Buffer、dNTPs、引物,最后加酶和模板。

2、液体应直接加到管底,且每加一种试剂后应更换新的吸头。

3、加完所有试剂后,应用手指轻弹混匀,然后低速离心数秒以收集管壁上沾有的液体。 4、酶类试剂应放置在冰盒上取用,用完后立即放回-20℃,以防酶失活。

5×Buffer dNTPs RNA酶抑制剂 Oligo(dT) 随机引物 反转录酶AMV 提取的RNA 总体积 4μl 6μl 1μl 1μl 1μl 1μl 6μl 20μl 反应条件:42℃ 1h

(三)PCR

实验安排:

每人做一管。

反应体系(50μl):按下列顺序加样

ddH2O 10×PCR Buffer dNTPs P1 P2 Taq cDNA template Total 32.7μl 5μl 4μl 2μl 2μl 0.3μl 4μl 50μl 反应程序:

预变性 94℃ 2min 变性 94℃ 30s 退火 50℃ 45s 延伸 72℃ 1min 30 cycles 终延伸 72℃ 10min

PCR产物的检测:琼脂糖凝胶电泳 1、电泳缓冲液TBE(10×)的配制:

称取Tris-base 54g,硼酸27.5g,并加入0.5M EDTA(pH8.0) 20ml,定溶至1000ml。 2、1.5%琼脂糖凝胶的配制:

称取1.5g琼脂糖于三角瓶中,加入10ml 10×TBE缓冲液,并加水定容至100ml,加热溶解后加入5μl EB(10mg/ml),摇匀后倒入插有梳子的电泳槽,待其凝固后拔去梳子即可用于电泳。 3、电泳检测:

取PCR产物5μl与Loading Buffer 1μl混合,加入到琼脂糖凝胶点样孔中,同时在样品孔旁加入5μl DL2000 DNA Marker作对照,以100V电压,50mA电流进行电泳,约15min后于紫外灯下观察结果。

注意事项:

1、EB有致癌性,电泳操作需戴手套进行。

2、禁止将盛有EB的器皿随意乱放,且不要戴有EB污染的手套随意拿其它无EB的试剂或仪器。

(四)PCR产物的纯化

实验安排:

每两人的PCR产物合并后作为一管,用PCR产物回收试剂盒(E.Z.N.A. Gel Extraction Kit)回收目的DNA。

操作步骤:

1、PCR产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳后,切下凝胶中含目的条带的胶粒,放入预先称好重量的空1.5ml Ep管中。

2、将装有胶粒的Ep管放在电子天平上再次称重,计算胶粒的重量。