第二章蛋白质化学 下载本文

内容发布更新时间 : 2024/5/12 11:16:31星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。

图1-1 肽平面

氨基酸顺序测定的一般步骤:

① 测定蛋白质分子中多肽链数目。根据蛋白质末端残基(氨基末端或羧基

末端)的摩尔数和蛋白质的分子量可以确定蛋白质分子中的多肽链数目; ② 拆分蛋白质分子的多肽链。 ③ 测定多肽链的氨基酸组成。 ④ 分析多肽链的N末端和C末端。 ⑤ 断裂多肽链内的二硫键。 ⑥ 多肽链断裂成肽段。 ⑦ 测定每个肽段的氨基酸顺序。 ⑧ 确定肽段在多肽链中的次序。 ⑨ 确定二硫键的位置。

图1-2 牛胰核糖核酸酶的化学结构

2、空间结构

蛋白质的空间结构是指蛋白质分子中原子和基团在空间的排列分布和肽链

的走向。蛋白质的构象

蛋白质的一级结构反映的是蛋白质的构型。

构型(configuration):指在立体异构体中取代原子或基团在空间的取向。没有共价键的破裂不能互变。

构象(conformation):指这些取代基团当单键旋转时可能形成的不同的立体结构。这种空间位置的改变不涉及共价键的破裂。

一个蛋白质的多肽链在生物体正常的温度和pH条件下,只有一种或很少几种构象。

① 二级结构:蛋白质主链本身的折叠和盘旋在空间形成的沟象,不涉及侧链构象。维持二级结构的主要作用力是氢键。

主要包括:α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规则卷曲等

Ⅰ α-螺旋(α-helix):多肽链主链骨架围绕螺旋的中心轴一圈一圈地上升而形成螺旋式构象。α-螺旋是一种常见的较为稳定、也较为致密的二级结构。 ?

右手螺旋

? 螺旋体中每隔3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈;螺距为0.54nm;每个氨

基酸残基沿轴上升高度 0.15nm;螺旋上升时,每个氨基酸残基沿轴旋转100°;螺旋体的表观直径约为0.6nm。

? 相邻螺旋之间形成链内氢键,氢键的取向几乎与中心轴平行;由肽键上

的N-H氢与它后面(N端)第四个残基上的C=O氧之间形成。 ? 氨基酸残基侧链伸向螺旋体外侧,其形状大小及电荷均影响螺旋稳定性;

若多肽链上连续存在酸性或碱性氨基酸残基、有脯氨酸或羟脯氨酸、侧链较大的氨基酸(Ile、Phe、Trp等)集中分布,均不利于螺旋形成。

Ⅱ β-折叠(β-pleated sheet):两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧向聚集在一起,相邻肽链主链上的-NH和C=O之间形成有规则的氢键。

? 多肽链主链呈锯齿状折叠构象

? 相邻两个氨基酸残基的轴向距离为0.35nm

? 所有的肽键都参与链间氢键的交联,氢键与肽链的长轴接近垂直 ? 侧链R基交替分布在片层平面的两侧 ? 平行式和反平行式

? 纤维状蛋白主要为反平行式;球状蛋白中两种方式同时存在 Ⅲ β-转角(β-turn):蛋白质分子中多肽链经常出现180°的回折。