DNAstar使用说明 下载本文

内容发布更新时间 : 2024/5/19 2:31:39星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。

DNAstar使用说明书

Editseq序列编辑Seqman序列拼接MegAlign序列比对 PrimerSeletSeqBulderGeneQuest 1.Editseq

(1) 找到ORF(open reading frame,开放阅读框)——理论氨基酸编码区

或者找到目标序列

Search find 加目标序列

(2) 反向互补:“Goodies”“ReverseComplement” 2.Seqman (1)“Add sequence”添加拼接序列,选中目标序列,“Add”、“的Done”导入目标序列

(2)如果导入为峰图文件,可双击文件名弹出峰图,用黑分隔线去除测序质量不好的区域(为黄色区域)

(3)修正后点击Assemble(拼接),若能拼接上,则在“conting”一栏显示 (4)双击“conting”可看到完整序列,以及两个峰图的重叠区域,若两个峰图完全匹配,则拼接可靠

(5)点击菜单栏的“conting”“saveconsensus”“singleFile”保存拼接好的序列

Seqman去除载体

当插入到载体上的片段,在分析前需要先去除载体序列。

Trim sequence ends Scam for vector “SetVector”,选前后载体(两栏都要选)“optionptimire sequence assembly order Don,t add single sequence Congtigs 3.MegAlign (1)“Flie”“New”再点击“File”“Entersequence”添加需对比的序列,“add”“Done”

The Jotun Hein method (2)点击“Align”有三种比对方式Clustal V Clustal W

Onepair先选中将要比对的两序列,选中“Alimentcolor”“vartioalsare”选颜色