使用Multiwfn图形化研究弱相互作用

内容发布更新时间 : 2024/11/8 3:25:11星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。

比RDG等值面用更大的函数数值。n=1时,由于远离分子时ρ(r)的收敛速度不像ρ(r)^(4/3)那样快,所以散点图中对应分子边缘区域的左上角的峰没那么明显。如果继续减小n,则弱相互作用与分子边缘区域就难以区分,数据点都一起缩到图中左下角。RDG函数原本是用在GGA密度泛函中表达电子密度梯度项,这也正是其名字的含义,之所以不是|▽ρ(r)|而要除以ρ(r)^(4/3),是为了消掉|▽ρ(r)|的量纲,使梯度的模成为无量纲的量。而RDG函数,即n=4/3的情况用在分析弱相互作用上最合适,是属于巧合。

12. 总结

RDG填色等值面分析方法是十分方便、有用的分析方法,原理简单易懂、适用范围广,在Promolecule近似下只需要提供分子坐标就能很快地得到结果,值得大力推广。Multiwfn对这种分析方法投入实际应用提供了极大便利,操作傻瓜化,不涉及到任何复杂的理论、概念。此方法也存在一些不足,也因此可能有进一步改进或发展的余地,比如等值面数值的选取、色彩刻度的上下限设定有一定随意性,那么是否有可能将这种分析定量化?其等值面面积和包围的体积是否也有一定意义?此分析方法的提出纯粹是从可视化便利的角度出发的,是否能找出其背后与ELF/LOL等函数的理论联系,进而组合、衍生出一个能分析更广泛问题的函数?笔者曾在《电子定域性的图形分析》一文中浅谈了实空间函数图形化分析方法的优点,本文的RDG填色等值面分析方法进一步显现了这类分析方法的用处,这类方法在未来必将得到进一步发展,并逐渐流行起来,也希望读者多加实践

联系客服:779662525#qq.com(#替换为@) 苏ICP备20003344号-4 ceshi