蛋白质的生物合成

内容发布更新时间 : 2024/11/8 1:35:44星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。

第六章 蛋白质的生物合成

蛋白质生物合成(protein biosynthesis)又称翻译(translation),是指以新生的mRNA为模板,把核酸的碱基序列转变为蛋白质中的氨基酸序列。

第一节 遗传密码 一、遗传密码的破译

? 遗传密码(genetic code)又称密码子、遗传密码子、三联体密码,指信使RNA(mRNA)分子上从5'端到3'端方向,由起始密码子AUG开始,每三个核苷酸组成的三联体。它决定肽链上某一个氨基酸或蛋白质合成的起始、终止信号。

二、遗传密码的基本特性 1、方向性

阅读方向和编码方向都是从5’ →3’ 2、连续性

在mRNA链上,从起始信号到终止信号,密码子的排列是连续的、不重叠的。

3、有起始密码子和终止密码子

起始密码子:AUG(多数)、GUG(极少数) 终止密码子:

UAA叫赭石密码子(ochre codon) UAG叫琥珀密码子(amber codon) UGA叫蛋白石密码子(opal codon)

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4、简并性

同一种氨基酸具有两个或更多密码子的现象称为密码子的简并性(degeneracy)

编码同一种氨基酸的密码子称为同义密码子(synonymous coden) 5、变偶性

1966年,Crick提出的变偶假说(wobble hypothesis)认为,遗传密码的专一性主要取决于前两位碱基,第三位碱基有一定的自由度,可以有一定程度的摆动。

根据变偶假说,一个tRNA究竟能识别多少个密码子,是由反密码子的第一位碱基的性质决定,如U可以和A或G配对,G可以和U或C配对,I可以和U、A、C配对,而A和C只能与U和G配对,这种现象称为变偶性(wobble)。

6、通用性和变异性

通用性是指无论是病毒、原核生物还是真核生物,基本上共用同一套遗传密码。

但1980年以来,逐渐在动物和酵母的线粒体及草履虫、腺病毒等生

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物中发现遗传密码的变异性。

三、可读框与重叠基因

1、可读框(open reading frame,ORF)

可读框是指DNA序列中,从起始密码子到终止密码子的一段连续的密码子区域。

当没有已知的蛋白产物时,该区域被称为可读框;

而当确知该可读框编码某一确定蛋白质时,它就被称为编码区。 一个可读框是潜在的编码区。 2、重叠基因(overlapping gene)

重叠基因是指一段DNA序列可以编码一条以上的多肽链。 重叠基因通常是在基因组较小而需要贮存更多信息的情况下产生。如噬菌体φX174的基因组

第二节 蛋白质生物合成的分子基础

一、mRNA是蛋白质生物合成的模板 ? 四个特点

成熟的mRNA存在于细胞质中,占总RNA的5%,种类多,寿命短,更新快。

? 原核细胞mRNA是多顺反子(polycistron)。 真核细胞mRNA是单顺反子(nonocistron)。

原核细胞mRNA起始密码子的上游含有一段富有嘌呤碱基的序列,称作SD序列(Shine-Dalgarno sequence),它可与16srRNA3’端富嘧啶区序列互补。

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SD序列是核糖体的结合位点(ribosome-binding site,RBS),是原核细胞起始所必需。

? 真核细胞mRNA5’端的帽子结构对核糖体进入部位(ribosome entry site)的识别起着一定作用。

真核细胞mRNA中的起始密码是最靠近5’端的AUG序列。 二、tRNA转运活化的氨基酸

tRNA的含量相对较多,占RNA的15%。

tRNA的二级结构呈三叶草型,三级结构呈倒L型。 1、tRNA分子上与蛋白质合成有关的位点 (1)3’端-CCA上的氨基酸接受位点 (2)识别氨酰-tRNA合成酶的位点

氨基酸的羧基与 tRNA的CCA末端腺苷的3′(或2′)羟基相结合的酯键。

(3)核糖体识别位点 (4)反密码子位点

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受体臂或称氨基酸臂

核糖体上的rRNA 识

负责和氨基酰tRNA聚合酶结合

双氢尿嘧啶环

对密码子的识别与配对。

负责连接两个区域

2、tRNA的主要功能

? tRNA在蛋白质的合成中特异性地转运氨基酸。 ? 通常将tRNA所转运的氨基酸标在右上角 如, tRNAPhe

? 大多数氨基酸都有几种tRNA用于转运 ? 运输同一种氨基酸的不同tRNA称为同工tRNA 3、氨基酸的活化

氨基酸的活化形式是氨酰-tRNA。 三、核糖体是蛋白质生物合成的部位 核糖体(ribosome)

又称核糖核蛋白颗粒(ribonucleoprotein particle),是细胞内进行蛋白质合成的场所,在蛋白质合成中起着中心作用。

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